Министерство иностранных дел Кыргызстана 21 сентября ответило на заявление МИД Таджикистана, призвав «не нагнетать обстановку, распространяя провокационную и недостоверную информацию о ситуации на кыргызско-таджикской границе».
Отмечается, что сообщение МИД РТ рассматривается «как очередная попытка ввести в заблуждение мировое сообщество».
«По состоянию на 21 сентября, кыргызская сторона исполнила все пункты последнего протокола, подписанного председателем ГКНБ КР Камчыбеков Ташиевым и председателем ГКНБ РТ Саймумином Ятимовым. Не соответствуют действительности предположения таджикского МИД о нахождении сил и средств кыргызской стороны в приграничных районах с РТ, а также нарушения ее воздушного пространства БПЛА, якобы залетающими с территории Кыргызстана», — говорится в заявлении.
При этом МИД КР утверждает, что таджикская сторона не в полной мере отвела тяжелую военную технику в пункты постоянной дислокации, часть все еще находится в приграничных территориях Мургабского, Исфаринского и Лахшского районов РТ.
21 сентября Министерство иностранных дел Таджикистана заявило, что «кыргызская сторона создает ложную видимость отвода войск и тяжелой военной техники от линии соприкосновения и укрывает их в приграничных населенных пунктах». Также было заявлено о «многочисленных нарушениях воздушного пространства РТ беспилотными летательными аппаратами, залетающими с территории Кыргызстана».
Обвинения, изложенные сторонами, пока не удается подтвердить или опровергнуть в независимых источниках.
20 сентября президент Кыргызстана Садыр Жапаров выступил на всеобщих дебатах 77-й сессии Генассамблеи ООН, где заявил о проблеме границы с Таджикистаном. В своем выступлении Жапаров напомнил о двух крупных приграничных конфликтах, унесших жизни десятков военных и мирных жителей, отметив, что «есть задокументированные доказательства противоправного нападения таджикской стороны».
14-17 сентября между военными Кыргызстана и Таджикистана произошло масштабное столкновение. В результате конфликта погибли 59 граждан Кыргызстана, почти 200 кыргызстанцев получили ранения. В результате обстрелов частично или полностью разрушены сотни объектов – дома, соцучреждения и военные объекты. Более 140 тысяч жителей приграничных с Таджикистаном сел были вынуждены покинуть свои дома. 18 сентября МИД Кыргызстана в своем заявлении обвинил Таджикистан в вооруженном акте агрессии.
Министерство иностранных дел Таджикистана сообщило о 41 жертве приграничного конфликта. Радио «Озоди», опираясь на данные собственных источников, опубликовало список 59 погибших таджикистанцев и написало о пострадавших в таджикских приграничных селах магазинах и домах. Подтвердить данные о жертвах и пострадавших с таджикской стороны из других независимых источников пока не представляется возможным.
19 сентября стало известно, что по итогам переговоров Кыргызстан и Таджикистан подписали мирный протокол по урегулированию вооруженного конфликта на приграничных территориях, предусматривающий полное прекращение боевых действий и отвод войск.